El sitio de la cueva de Shanidar se encuentra adyacente a la moderna aldea de Zawi Chemi Shanidar en el norte de Irak kurdo, en el río Zab en las montañas Zagros, uno de los principales afluentes del río Tigris. Entre 1953 y 1960, los restos esqueléticos de nueve neandertales fueron recuperados de la cueva, convirtiéndolo en uno de los sitios neandertales más importantes en el oeste de Asia en ese momento..
La cueva Shanidar mide unos 13,000 pies cuadrados (1,200 metros cuadrados) de área, o 75x75 pies (53x53 m) cuadrados. La boca de la cueva hoy mide unos 82 pies (25 m) de ancho y unos 26 pies (8 m) de altura. Los depósitos del sitio son de aproximadamente 46 pies (14 m) de espesor, que el excavador Ralph Solecki dividió en cuatro capas culturales principales, cada una separada por lo que el equipo de Solecki reconoció como discontinuidades discretas..
Los niveles más bajos, más antiguos y más importantes en Shanidar son los niveles de Mousterian, que representan un período de tiempo en que los neandertales vivieron allí hace unos 50,000 años. Dentro de estos depósitos se descubrieron nueve entierros humanos, al menos algunos de los cuales fueron entierros deliberados.
Los nueve entierros en Shanidar se encontraron debajo de una caída de rocas de la cueva, pero los excavadores estaban absolutamente seguros de que al menos algunos de los entierros tenían un propósito. Durante la década de 1960, esa fue una declaración impactante, porque los neandertales no se consideraban humanos, ciertamente no se pensaba que fueran capaces de cuidar a sus muertos. Desde entonces, se han recuperado considerablemente más pruebas de entierros del Paleolítico Medio en otros sitios de cuevas: en las cuevas de Qafzeh, Amud y Kebara (todas en Israel), Saint-Cesaire (Francia) y Dederiyeh (Siria)..
Algunos de los esqueletos de Shanidar muestran evidencia de violencia interpersonal entre cazadores y recolectores del Pleistoceno, un nivel de violencia también atestiguado en El Sidrón en España. Shanidar 3, un esqueleto masculino adulto bien conservado, sufrió una lesión parcialmente curada en una costilla. Se cree que esta lesión fue causada por un fuerte golpe de fuerza desde un punto de piedra o una cuchilla. Este es uno de los pocos ejemplos conocidos de lesiones traumáticas neandertales causadas por una herramienta de piedra; otros incluyen St. Cesaire en Francia y Skhul Cave en Israel. Las investigaciones experimentales de arqueología realizadas por el arqueólogo estadounidense Steven Churchill y sus colegas sugieren que esta lesión resultó de un disparo de un arma de proyectil de largo alcance..
El esqueleto conocido como Shanidar 1 era un hombre adulto mayor, que sobrevivió a una fractura aplastante de la cuenca del ojo izquierdo y a la pérdida de su antebrazo y mano derechos. Los arqueólogos Erik Trinkaus y Sebastien Villotte creen que este individuo también era sordo, debido a la presencia de crecimientos óseos en sus oídos. Estos esqueletos no solo exhiben evidencia interpersonal, sino que también indican que los neandertales se preocuparon por las personas que habían sido discapacitadas..
Shanidar fue el foco de los primeros estudios analíticos florales, que presentaron lo que se convirtió en una interpretación controvertida. Las muestras de suelo tomadas de sedimentos cerca de los entierros contenían una gran cantidad de polen de varios tipos de flores, incluida la moderna efedra de remedios herbales. Solecki y su colega investigadora Arlette Leroi-Gourhan interpretaron la abundancia de polen como evidencia de que las flores fueron enterradas con los cuerpos. Sin embargo, existe cierto debate sobre la fuente del polen, con cierta evidencia de que los restos de la planta pueden haber sido traídos al sitio por roedores excavadores, en lugar de ser colocados allí como flores por familiares afligidos. Estudios recientes de los paleontólogos Marta Fiacconi y Chris Hunt también sugieren que el polen encontrado en la cueva no es diferente al polen encontrado fuera de la cueva..
Los estudios microscópicos de los depósitos de cálculo, también conocidos como sarro, en los dientes de los neandertales en Shanidar encontraron restos vegetales de varios alimentos ricos en almidón que conformaban la dieta de los habitantes. Esas plantas incluían semillas de hierba, dátiles, tubérculos y legumbres. Alguna evidencia sugiere que al menos algunas de las plantas consumidas habían sido cocinadas, y también se encontraron granos de almidón preservados de cebada silvestre en las caras de algunas de las herramientas mousterianas en la cueva..
Las excavaciones originales se realizaron en la cueva durante la década de 1950 dirigida por el arqueólogo estadounidense Ralph S. Solecki. Trinkaus, entre otros, realizó investigaciones posteriores del sitio y de los artefactos y muestras de suelo recuperadas del sitio. Localmente, Shanidar estuvo habitada hasta hace poco por pastores kurdos, pero ahora es administrada por el servicio local de antigüedades y se ha convertido en un popular destino turístico kurdo.