TBE y TAE se usan como amortiguadores en biología molecular, principalmente para la electroforesis de ácidos nucleicos. Los tampones Tris se usan en condiciones de pH ligeramente básicas, como para la electroforesis de ADN, porque esto mantiene el ADN soluble en la solución y lo desprotona para que sea atraído hacia el electrodo positivo y migre a través de un gel. El EDTA es un ingrediente en la solución porque este agente quelante común protege los ácidos nucleicos de la degradación por enzimas. El EDTA quela los cationes divalentes que son cofactores de las nucleasas que pueden contaminar la muestra. Sin embargo, dado que el catión de magnesio es un cofactor para la ADN polimerasa y las enzimas de restricción, la concentración de EDTA se mantiene deliberadamente baja (alrededor de una concentración de 1 mM).
No necesita esterilizar la solución. Aunque la precipitación puede ocurrir después de un período de tiempo, la solución madre todavía es utilizable. Puede ajustar el pH utilizando un medidor de pH y la adición gota a gota de ácido clorhídrico concentrado (HCl). Está bien almacenar el tampón TBE a temperatura ambiente, aunque es posible que desee filtrar la solución de reserva a través de un filtro de 0,22 micras para eliminar las partículas que favorecerían la precipitación.
Guarde la botella de solución tampón 10X a temperatura ambiente. La refrigeración acelerará la precipitación..
La solución se diluye antes de su uso. Diluir 100 ml de 10X stock a 1 L con agua desionizada..
La ventaja de la solución 5X es que es menos probable que precipite.
Preparación
El uso accidental de una solución stock 5X o 10X le dará malos resultados porque se generará la mayor cantidad de calor. Además de darle una resolución deficiente, la muestra puede estar dañada.
Preparación
Agregue 100 ml de la solución 5X TBE a 900 ml de agua desionizada destilada. Mezcle bien antes de usar.
Aunque TBE y TAE son amortiguadores de electroforesis comunes, existen otras opciones para soluciones conductoras de baja molaridad, incluido el amortiguador de borato de litio y el amortiguador de borato de sodio. El problema con TBE y TAE es que los amortiguadores basados en Tris limitan el campo eléctrico que se puede usar en la electroforesis porque una carga excesiva provoca una temperatura desbocada.