El alquimista Es una novela escrita en dos partes y un epílogo. Gira en torno a un pastor andaluz llamado Santiago y su búsqueda de su propia leyenda personal, que lo lleva de su pueblo a las pirámides de Egipto. En sus viajes conoce a una serie de personajes que lo ayudan directamente o le enseñan una valiosa lección con el ejemplo..
Melquisedec y el alquimista se convierten en mentores, mientras que el inglés proporciona un ejemplo de lo que sucede si esperas adquirir conocimiento principalmente de los libros, y el comerciante de cristal le muestra el tipo de vida que lleva uno si no prestas atención a una leyenda personal.. El alquimista se desarrolla en un universo donde cada ser tiene su propia Leyenda personal, y donde el mundo tiene un alma, que es compartida por todo, desde los seres vivos hasta la materia dura.
Santiago es un joven pastor de Andalucía y está contento con un próximo viaje a un pueblo donde había estado el año anterior, ya que conoció a una chica con la que se enamoró. Ella es la hija de un comerciante que le compra lana, un hombre con problemas de confianza que exige que Santiago corte sus ovejas frente a él para evitar cualquier fraude. Duerme en una iglesia abandonada, donde tiene un sueño recurrente que implica ver pirámides. Cuando se lo explica a una mujer gitana, ella lo interpreta de manera bastante directa, diciendo que él debe viajar a Egipto para encontrar un tesoro enterrado. Al principio, duda porque disfruta de su vida como pastor y tuvo que ir en contra de la voluntad de sus padres para perseguirlo, ya que ellos querían que fuera sacerdote..
Luego se encuentra con un anciano que se llama Melquisedec, quien explica el concepto de "Leyenda personal", que es la realización personal que todos deben perseguir. Es "lo que siempre has querido lograr. Todos, cuando son jóvenes, saben cuál es su leyenda personal". Él le dice que debe escuchar presagios para encontrar su tesoro, y le da dos piedras mágicas, Urim y Thummim, que responden "sí" y "no" a las preguntas para las que no puede encontrar una respuesta por sí mismo..
Santiago llega a Tánger después de vender sus ovejas, pero una vez allí, un hombre que le dijo que podía llevarlo a las pirámides le roba todo su dinero. Esto no lo perturba demasiado, ya que comienza a trabajar para un comerciante de cristal, y en realidad refuerza el negocio de su empleador con sus ideas inteligentes. El comerciante de cristal solía tener una leyenda personal, haciendo una peregrinación a La Meca, pero se dio por vencido..
Una vez que Santiago gana suficiente dinero, no está seguro de qué hacer. Han pasado once meses, y no está seguro de si debería regresar a Andalucía para comprar ovejas con sus ganancias o continuar con su búsqueda. Eventualmente se une a una caravana para viajar a las pirámides. Allí, conoce a un compañero de viaje, conocido como el inglés, que se mete en la alquimia. Se dirige al oasis de Al-Fayoum para encontrarse con un alquimista, ya que espera aprender a convertir cualquier metal en oro. Mientras viaja por el desierto, Santiago aprende a ponerse en contacto con el Alma del Mundo..
Las guerras están hirviendo en el desierto, por lo que la caravana permanece en el oasis por el momento. Santiago decide ayudar al inglés a encontrar al alquimista. Su fuente de información es Fátima, una chica que conoce cuando recoge agua del pozo y de quien se enamora rápidamente. Él le propone matrimonio, y ella consiente, siempre que complete su búsqueda. Ella es una "mujer del desierto" que puede leer los presagios, y sabe que todos tienen que irse antes de regresar..
Después de aventurarse en el desierto, Santiago tiene una visión, cortesía de dos halcones que se atacan entre sí, del ataque del oasis. Atacar un oasis es una violación de las reglas del desierto, por lo que lo relata con los jefes, pero dicen que tendrá que pagar con su vida si el oasis no termina siendo atacado. Poco después de esta visión, se encuentra con un extraño vestido de negro que se sienta sobre un caballo blanco y se revela como el alquimista..
El oasis es atacado, y gracias a la advertencia de Santiago, los habitantes pueden derrotar a los asaltantes. Esto no pasa desapercibido para el alquimista que, a su vez, decide guiar a Santiago y ayudarlo a llegar a las pirámides. Sin embargo, pronto son capturados por otro grupo de guerreros en el desierto. El alquimista le dice a Santiago que, para progresar con el viaje, debe convertirse en el viento..
Al estar cada vez más familiarizado con el Alma del Mundo, Santiago se concentra en el desierto y finalmente logra convertirse en el viento. Esto asusta a los captores, quienes rápidamente lo liberan a él y al alquimista..
Llegan a un monasterio, donde el alquimista convierte algo de plomo en oro y lo divide. Su viaje se detiene aquí, ya que tiene que regresar al oasis, pero Santiago continúa y finalmente llega a las pirámides. Comienza a cavar en el lugar que soñaba con encontrar su tesoro, pero es atacado por los asaltantes y recibe una fuerte paliza. Uno de los asaltantes, al preguntarle qué estaba haciendo Santiago allí, lo ridiculiza por su sueño, mencionando que tuvo un sueño sobre un tesoro enterrado por una iglesia abandonada en España, y que no era lo suficientemente estúpido como para perseguirlo..
Esto le da a Santiago la respuesta que estaba buscando. Una vez que regresa a la iglesia en España, desentierra rápidamente el tesoro, recuerda que le debe una fracción a la gitana y decide reunirse con Fátima..