Robert E. Lee fue el comandante del Ejército del Norte de Virginia desde 1862 hasta el final de la Guerra Civil. En este papel, fue posiblemente el general más significativo de la Guerra Civil. Su capacidad de sacar el máximo provecho de sus comandantes y hombres permitió que la Confederación mantuviera su desafío al norte en contra de las crecientes probabilidades. Lee fue el comandante principal en varias batallas de la Guerra Civil..
Esta fue la primera batalla en la que el general Lee dirigió tropas confederadas en la Guerra Civil, sirviendo bajo el mando del general de brigada Albert Rust. Luchó contra los atrincheramientos del general de brigada Joseph Reynold en la cima de Cheat Mountain, en el oeste de Virginia. La resistencia federal fue feroz, y Lee finalmente suspendió el ataque. Fue llamado a Richmond el 30 de octubre, logrando pocos resultados en el oeste de Virginia. Esta fue una victoria de la Unión.
El 1 de junio de 1862, Lee recibió el mando del Ejército del Norte de Virginia. Entre el 25 de junio y el 1 de julio de 1862, dirigió a sus tropas en siete batallas, llamadas colectivamente las Batallas de los Siete Días.
La batalla más decisiva de la Campaña del Norte de Virginia, las tropas lideradas por Lee, Jackson y Longstreet lograron una gran victoria para la Confederación..
Esta batalla ocurrió como parte de la Campaña de Maryland. El ejército de la Unión pudo hacerse cargo de la posición de Lee en South Mountain. Sin embargo, McClellan no pudo perseguir al ejército devastado de Lee el día 15, lo que significaba que Lee tuvo tiempo de reagruparse en Sharpsburg.
McClellan finalmente se reunió con las tropas de Lee el día 16. El día más sangriento de batalla durante la Guerra Civil ocurrió el 17 de septiembre. Las tropas federales tenían una gran ventaja en número, pero Lee continuó luchando con todas sus fuerzas. Pudo contener el avance federal mientras sus tropas se retiraban a través del Potomac hacia Virginia. Los resultados no fueron concluyentes, aunque estratégicamente importantes para el ejército de la Unión..
El mayor general de la Unión Ambrose Burnside trató de tomar Fredericksburg. Los confederados ocuparon las alturas circundantes. Repelieron numerosos ataques. Burnside decidió al final retirarse. Esta fue una victoria confederada.
Considerado por muchos como la mayor victoria de Lee, marchó con sus tropas para encontrarse con las tropas federales que intentaban avanzar en la posición Confederada. La fuerza de la Unión dirigida por el mayor general Joseph Hooker decidió formar una defensa en Chancellorsville. "Stonewall" Jackson dirigió a sus tropas contra el flanco izquierdo federal expuesto, aplastando decisivamente al enemigo. Al final, la línea de la Unión se rompió y se retiraron. Lee perdió a uno de sus generales más capaces cuando Jackson fue asesinado por fuego amigo. Esta fue una victoria confederada.
En la batalla de Gettysburg, Lee intentó un asalto total contra las fuerzas de la Unión dirigidas por el mayor general George Meade. La lucha fue feroz en ambos lados. Sin embargo, el ejército de la Unión pudo rechazar a los confederados. Esta fue una victoria clave de la Unión.
La Batalla del desierto fue la primera de la ofensiva del general Ulysses S. Grant en el norte de Virginia durante la campaña Overland. La lucha fue feroz, pero los resultados no fueron concluyentes. Grant, sin embargo, no se retiró.
Grant y Meade intentaron continuar su marcha hacia Richmond en la Campaña Overland, pero fueron detenidos en el Palacio de Justicia de Spotsylvania. Durante las siguientes dos semanas, se produjeron varias batallas, lo que resultó en 30,000 bajas totales. Los resultados no fueron concluyentes, pero Grant pudo continuar su marcha hacia Richmond.
El Ejército de la Unión bajo Grant continuó avanzando en la Campaña Terrestre. Avanzaron hacia Cold Harbour. Sin embargo, el 2 de junio, ambos ejércitos estaban en el campo de batalla extendiéndose siete millas. Grant ordenó un ataque que resultó en una derrota para sus hombres. Eventualmente abandonó el campo de batalla, eligiendo acercarse a Richmond a través de la ciudad menos defendida de Petersburg. Esta fue una victoria confederada.
El Ejército de la Unión cruzó el río James en Deep Bottom para comenzar a amenazar a Richmond. Sin embargo, no tuvieron éxito, ya que los contraataques confederados los expulsaron. Finalmente se retiraron al otro lado del río James.
El general Robert E. Lee intentó en Appomattox Court House escapar de las tropas de la Unión y dirigirse hacia Lynchburg, donde los suministros estaban esperando. Sin embargo, los refuerzos de la Unión hicieron esto imposible. Lee se rindió a Grant.