Justin era el sobrino del emperador Justiniano: el hijo de la hermana de Justiniano, Vigilantia. Como miembro de la familia imperial, recibió una educación completa y disfrutó de considerables beneficios que no están disponibles para los ciudadanos menores del Imperio Romano de Oriente. Su poderosa posición puede ser la razón por la que poseía una extrema confianza en sí mismo que podría ser, y a menudo era, vista como arrogancia..
Justiniano no tenía hijos propios, por lo que se esperaba que uno de los hijos y nietos de los hermanos del emperador heredara la corona. Justin, como varios de sus primos, tenía un grupo de seguidores tanto dentro como fuera del entorno del palacio. Cuando Justiniano se acercaba al final de su vida, solo otro contendiente tenía alguna posibilidad real de suceder al emperador: el hijo del primo de Justin, Germanus, también llamado Justin. Algunos historiadores consideran que este otro Justin, un hombre de considerable capacidad militar, ha sido un mejor candidato para el puesto de gobernante. Desafortunadamente para él, el nostálgico recuerdo del emperador de su difunta esposa Theodora puede haber perjudicado sus posibilidades.
Es bien sabido que el emperador ha dependido en gran medida de la orientación de su esposa, y la influencia de Theodora se puede ver claramente en algunas de las leyes que Justiniano aprobó. Es posible que su aversión personal hacia Germanus impidiera que su esposo formara algún vínculo serio con los hijos de Germanus, incluido Justin. Además, el futuro emperador Justin II estaba casado con la sobrina de Theodora, Sophia. Por lo tanto, es probable que Justiniano tuviera sentimientos más cálidos por el hombre que lo sucedería. Y, de hecho, el emperador nombró a su sobrino Justin a la oficina de cura palatii. Este cargo generalmente lo ocupaba un individuo con el rango de spectabilis, que se ocupaba de los asuntos comerciales generales en el palacio, pero después de que Justin fue nominado, el título generalmente se otorgaba a miembros de la familia imperial u, ocasionalmente, a príncipes extranjeros..
Además, cuando Justiniano murió, el otro Justin estaba vigilando la frontera del Danubio en su papel de Maestro de los soldados en Illyricum. El futuro emperador estaba en Constantinopla, listo para aprovechar cualquier oportunidad..
Esa oportunidad llegó con la inesperada muerte de Justiniano..
Justiniano pudo haber sido consciente de su mortalidad, pero no hizo ninguna provisión para un sucesor. Murió repentinamente la noche del 14/15 de noviembre de 565, sin haber nombrado oficialmente quién tomaría su corona. Esto no impidió a los seguidores de Justin maniobrarlo hacia el trono. Aunque Justiniano probablemente murió mientras dormía, el chambelán Calínico afirmó que el emperador había designado al hijo de Vigilantia como su heredero con su último aliento..
En la madrugada del 15 de noviembre, el chambelán y un grupo de senadores que habían despertado de su sueño se apresuraron al palacio de Justin, donde fueron recibidos por Justin y su madre. Callinicus relató el deseo moribundo del emperador y, aunque hizo una demostración de renuencia, Justin rápidamente accedió a la solicitud de los senadores de tomar la corona. Escoltados por los senadores, Justin y Sophia se dirigieron al Gran Palacio, donde los Excubitors bloquearon las puertas y el patriarca coronó a Justin. Antes de que el resto de la ciudad supiera que Justiniano estaba muerto, tenían un nuevo emperador..
Por la mañana, Justin apareció en la caja imperial en el Hipódromo, donde se dirigió a la gente. Al día siguiente coronó a su esposa Augusta. Y, en cuestión de semanas, el otro Justin fue asesinado. Aunque la mayoría de la gente del día culpó a Sophia, no parece haber duda de que el nuevo emperador estaba detrás del asesinato..
Justin luego comenzó a trabajar para obtener el apoyo de la población.
Justiniano había abandonado el imperio en dificultades financieras. Justin pagó las deudas de su predecesor, remitió los impuestos vencidos y redujo los gastos. También restauró el consulado que había caducado en 541. Todo esto ayudó a la economía local, que le valió a Justin altas calificaciones tanto de la nobleza como de la población en general..
Pero las cosas no eran todas color de rosa en Constantinopla. En el segundo año del reinado de Justin tuvo lugar una conspiración, posiblemente motivada por el asesinato político del otro Justin. Los senadores Aetherios y Addaios evidentemente conspiraron para envenenar al nuevo emperador. Aetherios confesó, nombrando a Addaeus como su cómplice, y ambos fueron ejecutados. Las cosas funcionaron mucho mejor después de eso.
El cisma acaciano que había dividido a la Iglesia a fines del siglo V y principios del siglo VI no había terminado con la abolición de la filosofía herética que desencadenó la división. Las iglesias monofisitas habían crecido y se habían atrincherado en el Imperio Romano de Oriente. Theodora había sido un firme monofisita, y a medida que Justiniano envejecía se había inclinado más y más hacia la filosofía herética..
Inicialmente, Justin mostró una tolerancia religiosa bastante liberal. Hizo salir a los hombres de la iglesia monofisitas de la prisión y permitió que los obispos exiliados volvieran a casa. Al parecer, Justin quería unir a las distintas facciones monofisitas y, en última instancia, reunir la secta herética con el punto de vista ortodoxo (como se expresó en el Concilio de Calcedonia). Desafortunadamente, cada intento que hizo para facilitar la concordia se encontró con el rechazo de los extremistas monofisitas intransigentes. Finalmente, su tolerancia se convirtió en terquedad propia, e instituyó una política de persecución que duró mientras estuvo en control del imperio..
Justiniano había seguido una variedad de métodos para construir, mantener y preservar tierras bizantinas, y había logrado adquirir un territorio en Italia y el sur de Europa que había sido parte del antiguo Imperio Romano. Justin estaba decidido a destruir a los enemigos del imperio y no estaba dispuesto a comprometerse. Poco después de alcanzar el trono, recibió emisarios de los Avars y les negó los subsidios que su tío les había otorgado. Luego formó una alianza con los turcos occidentales de Asia Central, con quienes luchó contra los ávaros y posiblemente contra los persas..